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| 目的探讨miR-652在HBV相关肝细胞癌（HCC）中的表达情况及临床意义,分析靶基因功能并完成核心基因发掘。方法查找GEO数据库HBV相关HCC芯片,采用GEO2R分析得到前十位差异表达miRNAs。HCC肿瘤组织中miR-652表达检测采用miRNA荧光定量检测技术。比较分析不同临床特征分组情况下miR-652表达差异。MiR-652与肝癌患者生存率分析使用Kaplan-Meier plotter数据库。MiR-652靶基因分析使用miRWalk 2.0在线软件。靶基因GO功能注释和KEGG通路富集使用在线软件Web Gestalt。蛋白互作网络（PPI）分析采用在线软件string,并联合Cytoscape软件完成靶蛋白PPI构建及核心基因发掘。结果芯片数据发掘表明miR-652在HBV相关肝癌中表达显著升高。收集的肿瘤标本检测分析显示HBV感染HCC患者中miR-652表达显著高于未感染HBV的HCC患者。按照临床特征分组分析显示,miR-652表达在病理分级Ⅲ～Ⅳ级组显著高于Ⅰ～Ⅱ级组,在转移组显著高于未转移组,而在HBV DNA载量、肿瘤直径、TNM分期分组中无显著性差异。按照肿瘤直径、TNM分期、病理分级、肿瘤转移4个临床指标对HBV相关HCC和无HBV相关HCC作分组对比发现miR-652表达只在HBV相关HCC组的病理分级和肿瘤转移分层中对比表现出显著性差异。生存分析结果表明肝癌组织中miR-625高表达类型的肝癌患者10年期总生存率显著低于肝癌组织中miR-625低表达类型的肝癌患者。取交集后共获得miR-652调控的靶基因34个。GO富集分析显示miR-625的靶基因参与的功能作用主要指向RNA的转录翻译过程。对靶基因的KEGG分析显示主要富集在粘多糖生物合成与降解、β-丙氨酸代谢、RNA降解、半胱氨酸和蛋氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、嘌呤代谢等信号通路。蛋白网络互作和核心基因挖掘显示PTEN为靶基因集的核心蛋白。结论 miR-652与HBV患者的肝癌发生发展密切相关,并可能通过靶向PTEN为核心基因的互作网络参与调控肝细胞癌的疾病进程。 |
| 关键词: miR-652 肝细胞癌 HBV 生物信息学 PTEN |
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