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| 目的 通过生物信息学分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)的关键基因，以及关键基因表达与COPD肺组织免疫浸润的关系。方法 从GEO数据库下载基因芯片数据集GSE47460。使用R语言筛选正常组及COPD组样本并利用limma包鉴定差异表达基因(DEGs),使用ClusterProfiler包对DEGs进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用String数据库及Cytoscape软件对DEGs构建蛋白互作网络(PPI)并筛选关键基因。分析关键基因在正常组与COPD组以及在COPD组内不同严重程度的差异表达。绘制受试者工作特征曲线(ROC)评估关键基因对COPD不同严重程度的诊断性能。应用单样本基因富集分析(ssGSEA)评估关键基因表达与COPD肺组织免疫浸润的关系。结果 筛选出DEGs 75个，上调基因47个[矫正后P<0.05及log2(差异倍数)≥0.5],下调基因28个[矫正后P<0.05及log2(差异倍数)≤-0.5]。鉴定了3个在COPD组高表达且与COPD严重程度呈正相关的关键基因，分别是CD19、TNFRSF13B、POU2AF1。免疫浸润分析结果表明，COPD肺组织TNFRSF13B高表达组的免疫浸润程度更高。结论 通过生物信息学分析方法，筛选得到TNFRSF13B为COPD发病机制中的关键基因，且与COPD严重程度及肺组织免疫浸润密切相关，为COPD发病机制的研究提供一定的参考。 |
| 关键词: 慢性阻塞性肺疾病 关键基因 免疫浸润 生物信息学 |
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| 基金项目:国家自然科学基金(编号:82000052)； (泸州-医科大)应用基础研究项目(编号:2020LZXNYDJ11； 编号:2021LZXNYD-J25)； |
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