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高血压脑出血患者脑组织microRNA表达谱及生物信息学分析
胥成朗;肖文峰;刘峻伶;李强;陈礼刚;蒋正方;1,2
1. 西南医科大学附属医院神经外科;2. 四川绵阳四〇四医院神经外科
摘要:
目的 构建高血压脑出血患者脑组织差异表达miRNA,并进行生物信息学分析。方法 选取行高血压脑出血手术患者脑血肿腔壁脑组织标本16例,同期选择重型颅脑损伤且具有高血压病史患者脑组织标本16例作为对照组。通过Trizol法提取标本总RNA,筛选出差异表达的miRNA。利用生物信息学技术分析差异表达miRNA的特点,通过String数据库得到靶基因蛋白互作分析结果,Cytoscape软件进行miRNA-mRNA核心调控网络可视化。结果 实验组与对照组相比较共筛选出差异表达miRNA 43个(P<0.05),其中上调miRNA共7个,下调miRNA共36个。对差异miRNA的靶基因进行KEGG/GO富集分析,得到与高血压脑出血相关的信号通路:cAMP信号通路、ErbB信号通路、Calcium信号通路、Wnt信号通路(P<0.05)。构建miRNA-mRNA可视化网络图,发现关联度最高的miRNA为:hsa-miR-1303、hsa-miR-1972、hsa-miR-362-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-378d, PPI蛋白互作分析发现连接度最高的前三个基因为:MAPK1、GRB2和RAC1。结论 差异miRNA可能在自发性高血压脑出血的发病机制中具有重要作用,可能为自发性高血压脑出血的治疗及预防提供潜在治疗靶点及方向。
关键词:  miRNA  高血压脑出血  脑组织  调控网络  
DOI:
分类号:
基金项目:四川省科技计划项目(编号:2017JY0035);
Abstract:
Key words:  
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