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基于生物信息学筛选肺腺癌与抑郁症共病调控因子
杨宏;唐斌;1,2
1.德阳市精神卫生中心;2.西南医科大学
摘要:
目的 利用生物信息学方法分析肺腺癌、抑郁症与健康群体之间的差异表达基因,探究肺腺癌与抑郁症的共病机制。方法 从GEO数据库中获取肺腺癌和抑郁症相关的mRNA微阵列数据,数据分析获得与肺腺癌和抑郁症相关的共同差异表达基因,然后进行基因功能和信号通路富集分析,获得共同差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络和鉴定中枢基因,并对中枢基因在肺腺癌中的表达及生存情况进行分析。结果 数据分析筛选出肺腺癌和抑郁症共同差异表达基因有267个,功能富集分析发现共同差异基因主要参与细胞趋化、免疫受体活性、趋化因子受体结合、先天免疫系统等生命活动。进一步分析鉴定出10个中枢基因,其中GNLY、CXCL2、TLR4、PPBP和KLRD1基因在肺腺癌组织中显著低表达,且低表达的肺腺癌患者生存率更低。结论 GNLY、CXCL2、TLR4、PPBP和KLRD1基因与肺腺癌患者的预后密切相关,可能作为肺腺癌和抑郁症的共调控因子,通过炎症反应、免疫应答等信号通路调节肺腺癌和抑郁症的发生和发展。
关键词:  肺腺癌  抑郁症  中枢基因  调控网络  基因功能  
DOI:10.16252/j.cnki.issn1004-0501-2025.05.018
分类号:R749.4;R734.2;Q811.4
基金项目:
Abstract:
Key words:  
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